Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pnma3Q8JZW8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pnma3Q8JZW8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pnma3Q8JZW8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pnma3Q8JZW8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pnma3Q8JZW8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma3Q8JZW8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms