Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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