Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms