Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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