Protein–RNA interactions for Protein: Q505G8

Znf827, Zinc finger protein 827, mousemouse

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Length 1,078 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf827Q505G8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Znf827Q505G8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf827Q505G8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Znf827Q505G8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf827Q505G8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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