Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms