Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IHHQ14623 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IHHQ14623 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IHHQ14623 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IHHQ14623 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms