Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms