Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms