Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA6P60900 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms