Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms