Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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