Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10722F6VLK5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10722F6VLK5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms