Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms