Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms