Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMSN1Q9NSI8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms