Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms