Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Xrcc3Q9CXE6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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