Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms