Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms