Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms