Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rph3alQ768S4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms