Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SvipQ3UZP4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SvipQ3UZP4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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