Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms