Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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