Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms