Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms