Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms