Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcls1P49710 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcls1P49710 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcls1P49710 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcls1P49710 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms