Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNTAP49354 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNTAP49354 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms