Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms