Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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