Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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