Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms