Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USH1CQ9Y6N9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms