Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec4aQ9QZ15 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4aQ9QZ15 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175 ms