Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms