Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms