Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930449I24RikQ9D5E3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms