Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms