Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms