Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Hdac9Q99N13 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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