Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atl3Q91YH5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms