Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTTNBP2Q8WZ74 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms