Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BGC1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms