Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROQ12816 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROQ12816 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROQ12816 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROQ12816 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROQ12816 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROQ12816 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROQ12816 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROQ12816 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROQ12816 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROQ12816 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TROQ12816 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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