Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Pglyrp4Q0VB07 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Pglyrp4Q0VB07 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Pglyrp4Q0VB07 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Pglyrp4Q0VB07 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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