Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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