Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aqp4P55088 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms