Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms